首先，不利于对文件的控制。分析一下现在党委办公厅(室)制发的文件，大体有这样几种情况：一个是经党委常委会研究确定要发的文件；一个是贯彻上级会议或某一个文件精神要发的文件；一个是根据形势任务的需要，领导同志要求发的文件(多是电报通知)；再一个就是领导同志看了某一地方或某一部门的材料报告后，认为对全局工作有指导作用，提出予以转发的文件。部门报送的材料是不是这几种情况，是不是需要党委或党委办公厅(室)发文，党委办公厅(室)有责任先把一下关。如果不通过党委办公厅(室)，直接报送给领导同志，不利于办公厅(室)从总体上对发文的控制。
其次，不利于提高文件质量。一个文件从酝酿到形成下发，要经过多个层面有关人员的审改，这是十分必要的。从认识论上讲，人的认识要受到环境条件的制约。由于实际所处的位置毕竟与党委不在一个层次上，部门为党委起草的代拟稿，其内容难免带有部门的角度和色彩。因此，文稿由不同层面、不同机关进行审核把关，能够使文稿的内容更全面、更准确。
第三，不利于问题的解决。地方和部门请示的问题，有些事项领导同志个人可以答复，有些则不能答复。比如一些重大问题，有的需要党委的几个书记传阅商定，有的需要常委会讨论决定，有的还需要提交全委会讨论决定。如果直接报送领导同志个人，不仅牵扯领导同志的精力，搞不好还会误事。
从以上的分析可以看出，按程序办文是很有必要的，而绝不像有些同志认为的那样，“走程序”就是“走形式”。那么，如何解决这个问题呢?我认为，最重要的就是各地各部门要增强“程序意识”，报送公文时自觉按程序办事。再就是部门要确定一个处室，由这个处室统一对本部门上报的文件进行审核把关，并按照有关程序报送。特别是部门要求党委或党委办公厅(室)批转的文件，事先应和党委办公厅(室)有关处室沟通一下，看有无转发的必要。如有必要转发，部门可向党委办公厅(室)写个请示，经批准后，再草拟文稿报党委办公厅(室)按程序办理。从党委办公厅(室)方面讲，对不符合报送程序的文件，要及时给予提示。从实践的情况看，实行退办制度，即将违反报送程序的公文退原报送单位，并提出改进的要求，不失为解决问题的一个有效办法。但综合考虑，加强对部门文秘人员的培训，加强上下之间经常性的工作沟通，似比“退办”更好一些。对一些“倒转件”(即未经党委办公厅（室）审核，直接报领导同志批阅的文件)，党委办公厅（室）仍要抱着对工作负责的态度，按“正转件”办理，需要请有关部门会签的，要认真搞好会签，文稿修改变动比较大的，要报经领导同志审定后再发出。